Das Wesentliche habe ich dir eigentlich schon in meiner Antwort geschrieben.
Hier aber nochmals unter- und nebeneinander im Vergleich:
http://w3.restena.lu/ddnuc/Haus/themen/orga/struktur/struktur.htm
Die Strukturformel des Methan macht wie gesagt keinerlei Aussage über die Geometrie des Moleküls und vermittelt stattdessen sogar den Eindruck, dass die H-Atome im 90° bzw. 180° Winkel zueinander stehen, was aber nicht richtig ist. Methan hat 4 bindende Elektronenpaare, die natürlich negativ geladen sind und den größten Abstand voneinander erstreben, da sich negative Ladungen abstoßen. Das führt zwangsläufig zur Ausprägung der räumlichen Struktur eines Tetraeders, wobei die Verbindungsstrecken zwischen Tetraedermittelpunkt und zwei Ecken jeweils einen Winkel von 109,5° einschließen und mehr Abstand geht einfach nicht.
Betrachte nun die Zeichnung links unter der Strukturformel: Die beiden als Striche dargestellten Bindungen liegen mit dem C - Atom in der Tafelebene, die Bindung mit dem Dreieck geht aus der Tafelebene heraus und die gestrichelte Bindung tritt hinter die Tafelebene zurück. Wenn du jetzt alle Atome miteinander verbindest, erhältst du ein Tetraeder (Zeichnung rechts unter der Summenformel).
Gruß in Eile ...