Du musst das inhaltlich klar trennen, beides sind verschiedene Gleichgewichte, können aber nebeneinander vorliegen.
Ein neutraler pH Wert liegt immer bei 7, sodass H+ und OH- in der gleichen Konzentration vorliegen z.B. von reinem Wasser.
Beim isoelektrischen Punkt liegt Ladungsneutralität vor, sodass die Gesamtladung 0 ist. In der Theorie wäre eine Aminosäure ohne Seitengruppe nur mit COOH und NH2 bei neutralem pH Wert, aber in der Realtität ist das nicht so. Es hängt immer von der Säurestärke des Moleküls ab. Glutaminsäure hat einen IEP bei niedrigem pH Wert, da es eine hohe Säurestärke hat durch die zusätzliche COOH Gruppe und das Proton leicht abgibt.