Fmoc- und Boc-Schutzgruppen aktivieren nicht die Carboxygruppen von Aminosäuren. Sie dienen vielmehr dazu, die Aminogruppen der Aminosäuren zu schützen und so deren freie Reaktion zu verhindern. Durch die Verwendung von Fmoc- oder Boc-Schutzgruppen können selektive Reaktionen an den Carboxygruppen der Aminosäuren durchgeführt werden, während die Aminogruppen geschützt sind.